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He realizado la prueba cambiando el esquema cómo me has comentado pero tengo el mismo error:

<MSH.12>
    <VID.1>GACELA.2.5.v2</VID.1>
</MSH.12>

y me da el error:

<SOAP-ENV:Envelope xmlns:SOAP-ENV="http://schemas.xmlsoap.org/soap/envelope/" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:s="http://www.w3.org/2001/XMLSchema">
   <SOAP-ENV:Body>
      <SOAP-ENV:Fault>
         <faultcode>SOAP-ENV:Server</faultcode>
         <faultstring>Server Application Error</faultstring>
         <detail>
            <Exception>ERROR #6301: SAX XML Parser Error: &lt;INVALID OREF>zendElement+21^ITB.HL7.Format.HL7XMLv2.1 			if (..%SegObj.GetValueAt(..%FieldPath)="") { while processing Anonymous Stream at line 3 offset 25</Exception>
         </detail>
      </SOAP-ENV:Fault>
   </SOAP-ENV:Body>
</SOAP-ENV:Envelope>

Muchas gracias.

Hola @Luis Angel Pérez Ramos,

yo también pensé que el problema podría venir si uno de los segmentos obx.5 venía sólo con el valor y no con la estructura. Y probé de enviar sólo un segmento OBX.5  con la estructura correcta :

<OBX.5 LongName="Observation Value">
    <CE.1>UNAF</CE.1>
    <CE.2>Ulleres nasals d alt flux</CE.2>
</OBX.5>

Pero tengo el mismo error.

En mi pregunta, añadí el otro obx.5 para indicar que podían venir de los dos tipos y por eso tambien comentó que a lo mejor cuztomizar el ORU_RO1 aunque funcione tampoco me resolverá el problema.

Muchas gracias 

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